На 3 сентября 1939 г. "Warspite", "Barham" и "Malaya" входили в состав  Средиземноморского флота, a "Queen Elizabeth" и "Valiant" проходили модернизацию.

"Queen Elizabeth" после вступления в строй с января по май 1941 г. служил в составе Флота метрополии. В феврале еще не закончивший боевую подготовку корабль участвовал в поиске германских линкоров "Scharnhorst" и "Gneisenau".

В первой половине мая он пересек Средиземное море в восточном направлении и присоединился к флоту адмирала Каннингхэма, став его флагманом. Участвовал в прикрытии эвакуации английских войск из Греции и с о. Крит, в проводке конвоев на Мальту. 19 декабря 1941 г. во время стоянки в Александрии тяжело поврежден магнитными минами, установленными итальянскими боевыми плавцами из состава X флотилии MAS, доставленными ПЛ "Scire".

Взрыв произошел под КО "В", образовалась пробоина размером без малого 1000 м2 , оказались затоплены три КО, и корабль сел на грунт. Благодаря небольшой глубине в месте стоянки верхняя палуба "Queen Elizabeth" осталась над поверхностью воды.

Поднят весной 1942 г. и после временного ремонта в Александрии отправился в США, где на верфи ВМС в Норфолке прошел полный восстановительный ремонт с июня 1942 по июнь 1943 г. После возвращения в Англию вошел в состав Флота метрополии, но в конце года корабль решили перевести в Индийский океан.

С  января 1944 г. — флагман Восточного флота. Участвовал в авианосных рейдах на Сабанг в апреле и Сурабаю в мае 1944 г. В июне — июле вновь участвовал в операциях против Сабанга, но на этот раз. помимо палубной авиации, в дело вступила артиллерия "Queen Elizabeth".

В октябре — ноябре 1944 г. линкор прошел ремонт в Дурбане, после чего в конце ноября участвовал в авианосном рейде на нефтеперегонные заводы Белавана и Сабанга. В январе 1945 г. обеспечивал артиллерийскую поддержку при десанте на о. Рамри. В апреле в составе TF63 вновь бомбардировал Сабанг, Кар-Никобар и Порт-Блэйр на Адаманских о-вах.

В августе 1945 г. вернулся в Англию, 10 августа выведен в резерв в Росайте. 15.5.1948 продан на слом. Прибыл на судоразделочный завод 7.7.1948. "Warspite" до октября 1939 г. входил в состав Средиземноморского флота, после чего был переведен в Атлантику, где обеспечивал прикрытие конвоев, базируясь на Галифакс.

В начале декабря вошел в состав Флота метрополии в качестве флагмана, заменив подорвавшийся на мине "Nelson".